Di Kota Akademi yang maju secara ilmiah, keajaiban akan terjadi: penyelesaian lift luar angkasa pertama di dunia, “Endymion”. Sementara itu, seorang siswa sekolah menengah tertentu, Touma Kamijou, dan rekannya Index menjalani kehidupan sehari-hari mereka ketika mereka bertemu dan berteman dengan Arisa Meigo, penyanyi yang ceria dan ambisius. Ketika kejadian aneh mulai terjadi di seluruh kota, mereka mengarah pada penemuan plot rumit di sekitar Arisa dan Endymion. Segalanya menjadi lebih rumit ketika Stiyl Magnus muncul, menandakan bahwa dunia magis entah bagaimana terlibat juga …