Kazamatsuri, kota modern dan berkembang dengan baik yang terkenal dengan tanaman hijau yang tumbuh subur dan budaya Jepang yang kaya, adalah rumah bagi Kotarou Tennouji, seorang siswa sekolah menengah yang paling tidak mengetahui nilai-nilai bersama tempat itu. Puas untuk mengisi kantongnya dengan kesembronoan, bocah lelaki yang sombong dan usil itu menghabiskan waktunya untuk mengganggu Haruhiko yang mengaku berandalan, dan memanjakan perasaan asmara terhadap Kotori yang eksentrik.

Dilengkapi dengan kemampuan manusia super untuk secara permanen menulis ulang bagian manapun dari tubuhnya untuk melipatgandakan kekuatan atau kecepatannya, Kotarou secara alami tertarik pada dunia supernatural. Satu pertemuan khusus dengan satu-satunya anggota dan presiden Klub Penelitian Ilmu Gaib, “Penyihir” Akane Senri, mengarah ke Kotarou yang menghidupkan kembali Klub Ilmu Gaib dengan merekrut Kotori dan tiga anggota lainnya: siswa pindahan yang canggung Chihaya, perwakilan kelas yang ketat, Lucia, dan Shizuru yang sederhana. Saat Kotarou mengungkap rahasia tersembunyi dari setiap anggota Klub Ilmu Gaib melalui petualangan bersama mereka, dia pasti akan menghadapi takdir yang hanya bisa dia tulis ulang.